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次氯酸钠消毒主要的作用方式是通过它的水解形成次氯酸，次氯酸再进一步分解形成新生态氧，新生态氧的氧化性使菌体和病毒上的蛋白质等物质变性，从而致死病源微生物。其次，次氯酸在杀菌、杀病毒过程中，不仅可作用于细胞壁、病毒外壳，而且因次氯酸分子小，不带电荷，还可渗透入菌（病毒）体内，与菌（病毒）体蛋白、核酸和酶等高分子发生氧化反应，从而杀死病原微生物。再次，次氯酸产生出的氯离子还能显著改变细菌和病毒体的渗透压，使细胞丧失活性而死亡。
未加碘盐水溶液中含有Na+ 、H-等几种离子，按照电解理论，当插入电极时，在一定的电压下，电解质溶液由于离子的移动和电极反应，发生导电作用，这时CL-、OH-等负离子向阳极移动，而Na+、H+等正离子向阴极移动，并在相应的电极上发生放电，从而进行氧化还原反应，生产相应的物质。盐水溶液电解过程可用下列反应方程式表示：
NaCl=Na++Cl-
阳极电解作用：H2O=H+OH-2Cl-2e—→Cl2↑
阴极电解作用：2H-+2e—一H2↑在无隔膜电解装置中，电解质和电解生成物H2众溶液里向外逸出之外，其它均在一个电解槽内，由于H2在外逸过程中对溶液起到一定的搅拌作用，使两极间的电解生成物发生一系列的化学反应。反应方程式如下：
2NaCl+2H2O=通电=2NaOH+H2↑+Cl2↑ 2NaOH+Cl2=NaCl+NaClO+H2O
在无隔膜电解盐水，溶液的总方程式即为上列两个反应式相加得。
NaCl+H2O+2F→NaClO+H2↑ 其中：F为法拉第电解常数，其值为26.8安培小时，或96487库伦。
次氯酸钠主要用于漂白、工业废水处理、造纸、纺织、制药、精细化工、卫生消毒等众多领域